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输入的序列长度需大于10
输入重叠肽库设计参数:
主要用于全蛋白扫描,为筛选线性或连续性表位提供理想工具。根据目的蛋白或长肽设计关键短肽序列,可用来鉴定蛋白活性、免疫特异性以及抗体结合性。重叠肽库的设计主要由肽链长度和步移(offset number)两个参数决定,从目的蛋白N端逐步向C端截取设计,每次转移一个或几个氨基酸,序列之间有部分重合,最终形成重叠肽库。查看更多 »
输入的序列长度需在6-200AA之间
用来鉴别与多肽功能、稳定性和构象密切相关的特定的氨基酸位点。丙氨酸(Ala)是最小的手性氨基酸,通过将Ala系统性地、依次地替换序列中每一个氨基酸,来分辨出某一特定氨基酸对整个蛋白生物活性的影响。查看更多 »
输入的序列长度需在10-200AA之间
用以确定抗原表位的最短长度,通过系统性地截取两侧末端氨基酸获得。一般与丙氨酸筛查肽库结合使用,在使用丙氨酸确定表位关键残基后,截头肽库用来进一步确定最短表位序列及其作用。查看更多 »
请注明残基位置:(请使用;分开相邻位置)
位点扫描库是多肽序列优化的一个重要工具。在目的位点上替换全部的天然氨基酸,每条多肽替换一次,可用来鉴别活性较佳的多肽序列。 常用在复杂的蛋白混合物中鉴定T细胞抗原表位,或用相互依赖的子位点来定位底物,以减少合成和筛选工作量。查看更多 »
请输入随机残基位置:(N为2-3之间,N=2的随机组合为400,N=3的随机组合为8000+400+400+400=9200)(请使用;分开相邻位置)
是序列优化必不可少的工具。随机肽库生成的特有序列有提升多肽活性的潜力。该类肽库是利用"散弹枪"法,对选取的位点利用20种天然氨基酸进行随机自发取代而得到的。 查看更多 »
输入肽库大小(肽库最大数量为50):
是可变性较高的肽库,由原始序列的片段重新排列组合而成。 杂乱库可以展示所有可能的肽取代结构,是理想的序列优化手段,可用于蛋白、抗体、基因等的靶向分子探针。杂乱肽库可用作阴性对照。查看更多 »
输入的序列长度
针对目的蛋白设计T细胞相关抗原肽,将多肽逐步从两端截取为短肽,形成肽库,后将肽库混合成肽池,用以筛选T细胞最佳表位。T细胞截头肽库为筛选T细胞最佳表位提供了强有力的保证。 查看更多 »
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