针对目的蛋白设计T细胞相关抗原肽，将多肽逐步从两端截取为短肽，形成肽库，后将肽库混合成肽池，用以筛选T细胞最佳表位。T细胞截头肽库为筛选T细胞最佳表位提供了强有力的保证。

在大多数情况下，免疫治疗首先需要确定病毒或癌细胞上最具免疫刺激作用的表位。T细胞表位是短肽序列，长度从MHC I复合物上的8-11个氨基酸到MHC II复合物上的15-24个氨基酸不等。肽库是用于识别较大的表位中的短肽序列的理想工具，因为它们同时跨越数百种肽组合。T细胞截短肽库是独特的，因为它是由序列截短肽组合组成，从而确保整个T细胞表位是跨域的。这些截短的肽片段，通常从11-到8-mers，被汇集在一起。一旦确定了阳性细胞池，就可以对该池进行反容量，以确定T细胞表位序列。

使用凯发一触即发的T细胞截短肽库工具，首先输入感兴趣的蛋白序列。然后，选择池中最长肽序列的长度（MHC I为11，MHC II最长可达24AA）。该工具将生成跨越整个序列长度的11-mer、10-mer、9-mer和8-mer肽池（或对于其他肽序列，长度将为n-mer、(n-1)-mer、(n-2)-mer和(n-3)-mer）。

应用领域

Overlapping Peptide   Alanine Scanning       Truncation Library   Positional Scanning       Random Library   Scrambled Library       T Cell Truncated Library

参考文献

Franzoni G, Kurkure NV, Essler SE, Pedrera M, Everett HE, Bodman-Smith KB, Crooke HR, Graham SP. Proteome-wide screening reveals immunodominance in the CD8 T cell response against classical swine fever virus with antigen-specificity dependent on MHC class I haplotype expression. PLoS One. 2013 Dec 23;8(12):e84246.



McGuide TC, Leib SR, Mealey RH, Fraser DG, Prieur DJ. Presentation and binding affinity of equine infectious anemia virus CTL envelope and matrix protein epitopes by an expressed equine classical MHC class I molecule. J Immunol. 2003 Aug 15;171(4):1984-93.



Holtappels R, Lemmermann N, Thomas D, Renzaho A, Reddehase M. Identification of an atypical CD8 T cell epitope encoded by murine cytomegalovirus ORF-M54 gaining dominance after deletion of the immunodominant antiviral CD8 T cell specificities.  Med Microbiol Immunol. 2015; 2004: 317-326.



Buhrman JD, Jordan KR, Munson DJ, Moore BL, Kappler JW, Slansky JE. Improving antigenic peptide vaccines for cancer immunotherapy using a dominant tumor-specific T cell receptor. J Biol Chem. 2013 Nov 15;288(46):33213-25.